定量蛋白质组学新技术新方法研究获新进展

小林

定量蛋白质组学新技术新方法研究获新进展

    9月3日，由中科院大连化学物理研究所邹汉法、叶明亮研究员带领团队，在定量蛋白质组学新技术新方法方面取得新进展，发展了一种基于胰蛋白酶催化的N端稳定同位素编码的氨基酸标记的相对定量蛋白质组学方法。相关研究成果发表在德国《应用化学》上。    蛋白质组学研究的主要内容是蛋白质的表达水平，翻译后修饰，蛋白与蛋白相互作用等，最终的研究目的是大规模水平上研究蛋白质的特征与功能，而定量蛋白质组学技术应该说是蛋白质组学的重要的一部分，它可以在实现对蛋白质鉴定的基础上，对蛋白质的表达水平及其存在的变化形式进行检测和分析。    该项研究工作中，分别利用胰蛋白酶的水解活性和连接活性，实现了只采用一种酶就完成蛋白酶解和多肽标记两步操作。胰蛋白酶首先作为水解酶，将蛋白质酶解成肽段，然后又作为连接酶，催化稳定同位素编码的精氨酸连接到胰蛋白酶酶解后的肽段的N末端，从而实现对肽段和蛋白的相对定量。    该酶促标记反应条件温和，具有高度区域专一性，大大减少了肽段降解和副反应的发生；由于标记反应只发生在肽段的N末端，而且每个肽段只标记上一个含同位素的氨基酸，所以不会对翻译后修饰的定量研究产生影响；另外与一般的标记方法不同的是本标记反应后形成新的肽键，由于新的肽键也能在串联质谱中解离，所以新形成的其他碎片离子，能大大提高肽段鉴定的准确度。    这种酶促标记反应为蛋白质组学定量分析提供了一个全新的方法和技术平台，具有良好的应用前景。